尽管辉夜在不断挣扎，但是显然她已经无力挣脱，“阴阳太极图”消磨一切，金桥镇压一切，辉夜很快便被水门封印起来。
没错，就是封印！
而忍界当中，随着辉夜再次被封印，始球空间完全崩裂，露出水门的身形，看着安然无恙的水门，众人这才松了一口气。
这半天时间，对普通忍者而言，心情就像是做了过山车一样，先是出来个宇智波斑，吸收十尾，成为了十尾人柱力，准备用“无限月读”将所有人封印。
后来又冒出个号称“忍界始祖”的大筒木辉夜，更是意图收回所有散落在忍界的查克拉。
可以自始至终，这些不断冒出来的忍界金字塔顶级的存在，统统被四代火影，波风水门自己镇压。
宇智波斑也好，大筒木辉夜也罢，没有惊起一点风浪，就被水门强势镇压！
但是大家不会忘记，大筒木辉夜降临的那一刻，显露出的恐怖气势，那是独属于世间万物主宰者的气势！
而强如这位查克拉始祖，都被水门一力镇压，可见水门的可怕！
看着汇集在一处的忍界联军，看着那些已经恢复过来的各村的影们，水门没有多说什么，事实胜于一切。
人类因为种种私心，很难得到绝对的和平，不过有水门这尊大佛在，可以预见，相对的和平会持续很长一段时间，再往后的事，水门也管不到了。
“大筒木辉夜已经被我重新封印，我们胜利了！”说完这句话，水门带着久辛奈，金光一闪，直接消失在众人眼前。
而在水门消失以后，五大国的忍者联军们，爆发出热烈的欢呼声，不分国籍，相互拥抱在一起，庆祝这次伟大的胜利。
人群当中，只有鸣人充满怨念，那对不靠谱的父母，又抛下他，享受二人世界去了。
…
接下来的一段时间，木叶又传出来一个大消息，四代火影波风水门正式退位，宣布由宇智波带土继任第五代火影。
由于水门在第四次忍界大战里的强势表现，木叶这次的权力过度相当顺利，各国高层还派出使者前来观礼，木叶的地位，再次被推升至忍界顶峰！
此后的是，水门便不再关注了，因为他有一件更加重要的事要做，那就是培育神树。
这一天，他孤身一人，利用“飞雷神结界”来到月球之上，开始了他的计划。
原着里，对于神树果实的培育过程，有着这样的描述。
大筒木一族的人会前往不同的星球种植神树，而十尾则是神树的树苗，大筒木一族的人首先将十尾种植在大地上，让它长成神树后吞噬星球，之后结出神树果实。
而要想将十尾培养成神树，必须满足一个特殊的条件：让十尾将大筒木活生生吃掉！
十尾成长为神树后，神树的根会蔓延到星球的各个角落，之后不断吸取这颗星球上一切万物生灵的查克拉，吸光所有生物的查克拉的不久之后，神树就会结出巨大的神树果实！
原本那颗大筒木辉夜带来的十尾已经被她种下，千年前已经结出过神树果实，并被辉夜吞食。
还好，水门这些年也不是吃干饭的，他为此也做了不少准备。
“嗡！”
水门心念一动，眉心位置的“轮回转生眼”瞬间开启！
这是他以“转生眼”融合六道仙人的一般“轮回眼”童力以后，最终的产物，同样拥有“轮回眼”的种种权能！
“通灵术！”水门使出通灵之术，召唤出了一段残缺的树根。
这段树根赫然是千年前那棵神树的残留物，也是“龙脉查克拉”的间接孕育者。
当年水门得到了“龙脉查克拉”的认可以后，就知道了这段神树根部的存在。
数千年前，也许是机缘巧合，幸存的一段埋藏在地脉深处的神树树根与地脉里的查克拉互相融合，互相依存，最终孕育了龙脉。
龙脉的存在，又反过来反补神树树根，使它得以存活千年，不至于枯萎死去。
直到水门得到了“龙脉查克拉”，也同时得到了这段神树树根，这些年来，更是不断以自然能量转化出的仙术查克拉喂养，使得这段神树树根重现生机，甚至进化到了神树的第一阶段。
感应到水门的召唤，神树树根屁颠颠的化为一个独眼，独耳，独口的畸形生物爬了过来。
讨好的看着水门，等待着水门的投喂。
“不要急，今天给你带来了一样好东西。”说着水门取出了被他封印的大筒木辉夜。
看到了大筒木辉夜，神树树根似乎明白了什么，充满渴望的用一颗独目狠狠地看着大筒木辉夜。
千年前，辉夜吞食了神树果实，成为“查克拉始祖”，千年后，光阴轮转，似曾相识的一幕又将上演，不过这次是倒过来了。
“心急什么，给你吧！”水门微微一笑，将被封印的辉夜扔向神树树根的畸形变异体。
“啊呜！”一口，神树树根的变异体勐地张嘴，直接将辉夜吞了进去！
“噗通！噗通！噗通！”
吞下辉夜以后，神树树根的畸变体突然开始剧烈抖动起来，身躯不断变大，很快就变得如尾兽那般大小，只是比起十尾，体型上还差不少。
这还没完！
“突！突！突！”
十根巨大的根系破破体而出，狠狠地扎进月球地脉之下。
而后一棵巨树不断凝聚成型，往天上长去。
“真是造化玄奇，这便是十尾化生的神树了！”水门抬头凝实，那棵神树不断上长，树干不断变粗的同时，高度也越来越高。
终于，在生长了数百米的高度以后，神树停止生长，顶部位置也出现一个花包模样的事物，似乎在孕育着什么！
可惜，月球之上，查克拉也好，生命能量也好，自然能量也好，都少的可怜，眼见着花骨朵一样的花包就这样立在那里，纹丝不动。
水门同时感应到新生的神树传递来的一丝渴望，吞食万物的渴望！
只要吞食一切，它便可以完全成熟，结出完美的“神树果实”！