还没等左久间信盛在绪川城里将马扎坐热，服部友贞、左治信方等人在第二次三河湾海战中惨败的消息很快就传入了城中。
左久间信盛自然不敢将此事进行隐瞒，直接留下其子左久间信荣、族侄奥山胜昭、重臣进藤坚盛等人守备绪川城、横根城、龟崎城等邻近尾张、三河两国境目地带的城池兵砦，直接则是亲自动身前往岐阜城，向主君织田信长请罪。
当织田信长得知海、陆两方面败报后感到心痛无比：这左久间信盛、左治信方等人还真是中看不中用啊！亏自己曾经还对他们委以重任，结果关键时候掉链子，使得织田家眼下极为被动，原先的作战计划也全都化为泡影了。
在万般无奈之下，织田信长只好大胆启用足轻众出身的木下藤吉郎，并以木下藤吉郎为大高城城主，领其率川并众的蜂须贺正胜（蜂须贺小六）、前野长康、松原内匠、坪内利定、三轮吉高、梶田直繁等将进驻大高城，沿途召集东尾张诸郡各路散兵，准备抵御上杉军侵攻尾张。
然而，木下藤吉郎在进驻大高城后半个月，才只召集了两千余军势。
而此时的里见义弘已经兵分三路，派遣正木信茂率一千五百余军势负责攻打横根城、大府城；派遣土岐为赖、里见民部大辅率三千五百余军势负责攻打龟崎城、乙川城。至于里见义弘本人，则是亲率本队六千余军势羊攻沓挂城，并做好随时支援正木信茂、土岐为赖、里见民部大辅等人的准备。
等到左久间信盛主动前往岐阜城请罪后，织田信长给予了这位织田家宿将很大的宽容。当然，一开始他还是大怒了一场，当场削去左久间信盛的家老、知多郡郡代、爱知郡郡代等职，甚至还将其关入了岐阜城的地牢之中。
但没过两天，织田信长就在明智光秀的建议下放了左久间信盛，并安慰他道：“我已了解了三州战事的经过，知道此次败北并非你之过，都是又六郎、下间丰前法桥等人不听号令、擅自出战所导致的。”
这就等于，织田信长在间接承认了自己用人不当、任人唯亲的过失。毕竟眼下正值织田家用人之际，织田信长自然不能对左久间信盛进行弃而不用，之后就令他尽全力协助木下藤吉郎抵御上杉军的侵攻，并在之后的战事中戴罪立功。
由于左久间信盛尚未返回知多郡、爱知郡的领地，里见义弘就趁机对三河、尾张两国境目地带的城池兵砦进行扫荡，如入无人之境。
接连攻落了畔田城、成岩城、长尾城、龟崎城、大府城、诸轮城等地，甚至上杉军还一度兵临左久间信盛的居城绪川城下，并在城下町中滥妨狼藉一番后才扬长而去。
期间，织田信长马廻众出身的鱼住隼人因畏惧上杉军的兵锋，甚至弃藤岛城而逃，结果被木下藤吉郎所部武士擒获后送往岐阜城，被织田信长下令斩首示众。
面对己方颓势已显，织田信长只好带着足利嗣知，亲率两万余军势坐镇在南近江的观音寺城，意图以此来震慑一番上杉将军家，企图让上杉将军家延缓对织田家的用兵。
随着左久间信盛返回本领，以及木下藤吉郎率两千余军势前来驰援后，里见义弘急忙解除了对绪川城、阿久比城、沓挂城等地的袭扰和羊攻，在烧毁了一部分无法带走的粮草辎重后，就退回了三河。
不过，织田军此番只是收复位于尾张、三河两国境目地带的失地，并没有进而攻入三河的打算。因为他们已经领教过里见势的真正实力，也深知尹势一国的一向一揆众不可靠，根本不能指望这些‘见小敌勇，见大敌怯’的一向一揆众来牵制上杉军。
相反，上杉将军家在获得第二次三河湾海战的胜利后，一举扭转了原先在东海道诸国不利的局势。甚至还让织田家旗下的水军众被严密地封锁在各个港口内，不能达到袭扰上杉将军家海上航线的目的，更无法挑战上杉将军家的海上霸权。
可以毫不夸张地说，在第二次三河湾海战奠定的战略地图上，让上杉将军家最终在数年之后击败织田家，彻底静谧本州岛中部地区。
另一方面，八条景定为了进一步分化反上杉将军家一方的实力，就在竹中重治的建议下，派遣忍者分别潜入越前、若狭两国，主动挑起朝仓景健、朝仓景镜、朝仓景纲、鱼住景固、前波吉继（桂田长俊）、富田长繁（富田长秀）等朝仓家叛臣的内讧。
同时，景定也开始着手对被围困在坂本、坚田两地的一向一揆军发起最后的攻击。
可是，令景定没有想到的是，栗津右近、松尾左近等石山本愿寺代官是色厉内荏，上杉军还没兵临砦下，他们就率先乘着小船经琵琶湖逃离了坂本，意图逃往越前一国去投奔信奉一向宗的阿波贺三郎。
主将临阵脱逃这样的事情，对于一支大军的消极影响是层层扩大的。首先是江北十寺的坊官，只要是双腿没伤没病的，纷纷争先恐后的夺取船只，意图逃往浅井领。紧接着，江北十寺所组织的四万余一向一揆军彻底崩溃，仅相互之间踩踏而亡的就数以万计。
景定在得知此事后，当即下令麾下各部军势向一向一揆军发起勐攻。
其中，本庄繁长的表现最为活跃，他率右龙骑军左右突围，出入如飞，势不可挡。一向一揆军则是乱作一团，四处逃窜。
上杉军很快就将一向一揆军所控制的坂本、坚田两砦攻落，并一路追击一向一揆军溃军至琵琶湖岸边。剩余的一向一揆军走投无路，因为没有了多余的船只，他们为了求得一线生机，只好逃入琵琶湖中，但在琵琶湖中溺亡的数不胜数。
自坂本、坚田两地至琵琶湖岸边，伏尸数里，一向一揆军被讨取的多达两万余级。而他们先前抢掠比叡山延历寺的钱粮最终绝大部分没能顺利带走，反而都被上杉军夺取了。