在铁木真汗的追击下，蔑儿乞惕部首领狼狈逃走，答亦儿兀孙等人投降。但他同蔑儿乞惕人的斗争还在继续。大多数蔑儿乞惕人已投降，铁木真汗将他们编人自己的军队，命他们在军队中看守辎重。但是，一等铁木真汗离开，这些蔑儿乞惕人便抢掠由他们负责看守的辎重财物，然后携带这些财物反叛而去。他们回到他们的故土贝加尔湖南岸下色楞格河流域，在深山密林中立寨，准备顽抗。兀洼思一儿乞惕人也反叛而去，立寨于忽鲁合不察儿山口。兀都亦惕一儿乞惕人立寨于台合勒山之最深远处，砍倒树木，阻塞要道，准备抵抗到底。铁木真汗闻说这些蔑儿乞惕人反叛而去，立即命锁儿罕失刺之子沉白为将，率领左军前往征讨围剿。沉白轻而易举就荡平了上述蔑儿乞惕人所立之山寨。为了防止这些森林狩猎人再次滋事，铁木真汗命令蒙古军将领将他们瓜分，从而解散了这些蔑儿乞惕部落。
在这段时间，蔑儿乞惕部首领脱黑脱阿及其儿子们已同其多数百姓失去了联系，在蒙古西部边陲同乃蛮部王子屈出律过着流亡生活。铁木真汗率部穷追，追至阿尔泰山前。当时已是冬季（104年冬），铁木真汗便驻冬于阿尔泰山山麓。这时战场已移至乌兰达班——塔并兀刺群山。这些山岭峻拔高耸，峰顶海拔高达4000米。这是阿尔泰山的蒙古部分和俄国部分的交界处。科布多河发源于山东侧，向东流去，灌溉着一大片湖泊地区。山西侧是额尔齐斯河之支流不黑都儿麻河的发源地。乌兰达斑——塔并兀刺山地区非常荒凉。北部靠近科布多河一带很贫脊，只在海拔000米至400米的山上有一些落叶松。但在南部山区，山上的森林则一直下延到海拔1090米处，主要有雪松、欧洲山杨、杨树、柳树和冷杉。
脱黑脱阿和屈出律来到不黑都儿麻河畔，即今苏联塞米巴拉金斯克州内塞米巴拉金斯克市与阿尔泰斯克堡之间，集合起剩下的一些力量，企图凭借险要的地形重振旗鼓。105年春，铁木真汗率军追来，两军又展开战斗。
脱黑脱阿正战斗时，不知哪里飞来一箭，正中要害，当即身亡。在此危急时刻，他的两个儿子来不及埋葬也来不及运走他的尸体，匆忙间只好砍下他的头，向遗体作最后的告别，携其头逃去。蔑儿乞惕人和乃蛮人向西南方向鼠窜，许多人在抢渡额尔齐斯河时落水而死（时值春暖，积雪融化，河水暴涨）。少数侥幸渡过河的人，都争相逃命，各奔东西，星散而已。乃蛮部汗位继承人屈出律一直向南逃奔，越过准噶尔草原，翻过天山，沿畏兀儿人地界库车一侧面行，过哈刺鲁之地（即今巴尔喀什湖东南之谢米列奇耶），最后来到哈刺契丹帝国（伊塞克湖以东今俄国土耳其斯坦境内）。在那里，命运为他作了出人意外的安排。这个事情留到成吉思汗西征时再说，你要记得“屈出律”这个名字哦。
至于缓儿乞惕人忽都、合勒和赤刺温这三位王子，他们先逃到畏兀儿地面，想控制和占领别失八里、吐鲁番、库车等肥沃的绿洲。但是，畏兀儿王巴尔术派兵把他们驱逐出了界外。这一帮蔑儿乞惕人便向北流窜，来到巴尔喀什湖草原，在塔尔巴哈台之叶密立河流域悲惨地流浪了十来年。
后来公元117年的一天，成吉思汗忽然想起了这些幸存的敌人，便命令他手下最优秀的战略家速不台（有的史书叫速别额台）前去征剿。他对速不台说：“他们惨败之后，已经是带套的野马，中箭的伤鹿，逃奔在外。你今天率领一支军马，前往剿灭他们。如果他们变成飞鸟，你就变成雄鹰；如果他们变成地鼠，你就变成铁锹；如果他们变成鱼群，你就变成丝网……凡是违反你号令的，军法从事。”
接着，铁老大毫不掩饰地说明了他要派兵剿灭蔑儿乞惕部残余的原因。可以看出，童年时期的不幸遭遇给铁老大留下了多么辛酸痛苦的难忘的记忆。他对速不台说：“这帮蔑儿乞惕人，我早已恨之入骨矣！他们曾经逼迫我逃入不儿罕台勒敦之山，并阻绝路口，想生擒我而围我在这坐山之中。那时我还年少，心中相当害怕……到得今天，我发誓一定要搞定他们！即使需要多年多月之久，我也要穷追不止，纵然是在天涯海角，我也要前往追杀剿灭。一定要把那帮可恶的人消灭了才能罢休！你今天代我出征，我的心也随你远征了，你这样想着，就会获得长生天的护佑而必胜！”
为了使速不台所带领的军队能顺利通过阿尔泰山和塔尔巴哈台山区，铁老大命令工匠为他们打造了一种经得起山路颠簸的铁车。速不台率领一支如此装备起来的军队，从扎木河经塔尔巴哈台直至垂河（即今之楚河）北岸巴尔喀什湖西部“饥饿草原”，穷追猛打，消灭了蔑儿乞惕部残余，圆满地完成了铁老大交给他的使命。
铁木真对敌对的蒙古部落蔑儿乞惕部的仇恨可说是根深蒂固的。首先，草原牧民对泰加森林中的猎人的由来已久的仇恨，其次，这是一种个人的仇恨。你记得的，蔑儿乞惕人曾掳掠过铁木真的老婆，让她在自己敌人的身边睡了一段时间。铁木真心里可能也认为长子术赤就是蔑儿乞惕人的后代，这是一件相当痛苦的事情。
蔑儿乞惕人虽也是蒙古族人，但他们是属于那些不能被容忍的蒙古人，他们已不能成为统一的新蒙古民族的一员了。
《史集》记载成吉思汗派遣速不台率军追击的脱黑脱阿的儿子，有忽都、赤剌温、马札儿、忽勒秃罕四人。118年，速不台所率军队将忽都等篾儿乞惕残部包围在垂河地区，全部歼灭。其四子忽勒秃罕是个箭无虚发的神箭手，仗着他的神箭，他逃出了包围圈，逃奔钦察人处去。不久，术赤派遣军队去追捕他，把他捉住。术赤久闻他的神射，便立了一个靶，命他远射之。忽勒秃罕一发中的，接着又发一箭，正中前箭之羽缝。这使术赤惊叹不已，所谓英雄惜英雄，便派使者到成吉思汗处请求留忽勒秃罕活命。成吉思汗想起以前从篾儿乞惕人处吃过的种种苦头，不允术赤所请，他说道：“再也没有比篾儿乞惕部更坏的部落了：我们同他们打过多少次仗！我们受过他们很多骚扰。怎么能留他活着，让他重新掀起叛乱？我已经为你们争得了这么多国土和军队，区区忽勒秃罕算得了什么？对于国家的敌人来说，没有比坟墓更好的地方了。”术赤于是只好处死了忽勒秃罕（见《史集》汉译本）。（未完待续）