也谁让佐助是主角呢，佐助的命运自然就与他人不同。开始宇智波一族叛乱的时候，唯独留下了佐助，这可不是木叶高层怜悯佐助一人，而是佐助的哥哥鼬以此为筹码做出的灭族之事，用岸本的话说鼬为村子和平着想才去灭了自己一族，又有最心爱的弟弟佐助放不下，鼬也是有私心的，也不是因为佐助年少无知才会被放过，别的宇智波人家也有无知小孩可也都被鼬杀了。木叶旅行承诺让佐助平安的长大。
可是佐助本人并不知道这些事情，他只当是自己哥哥杀害了一族，要为全族报仇就得有力量，于是乎佐助就为了得到力量渐渐的迷失了。这才被大蛇丸盯上，而且佐助还是自愿跟随大蛇丸走的，早先的时候仍然是第七班负责人把他追回。时间长了之后佐助为变强有些丧心病狂，待到他知道所谓真相之后，对木叶恨之入骨，这时候彻底黑化成了木叶乃至是整个忍界的敌人，被木叶村定义为叛忍，就连以前最喜欢佐助的小樱都把佐助当做叛徒，唯独还期盼他回心转意的只有卡卡西和鸣人。
很长一段时间佐助所做的事情以咱们中国人的道德观念来看都是不可被原谅的，比如说佐助用着师父卡卡西教会他的千鸟大骂卡卡西不配拥有血轮眼，还扬言要杀了卡卡西，卡卡西有一丝对不起他的地方吗？确实也下杀手了只是没杀成罢了，就像是大蛇丸杀三代一样，弑师好像是《火影忍者》的传统戏码。当初对战奇拉比时香磷舍命救佐助，后来佐助为达目的毫不吝啬香磷的生命，是非不分恩怨不明，冤有头债有主，真正坑害他们宇智波一族的团藏也被他杀了，大仇也报了，却还想要毁灭木叶，这时候的佐助彻底没救了。第四次忍战把佐助转到鸣人一方我感觉过于生硬，断层感太重，怎么就突然洗心革面了呢？
杀人犯因为对方凭借实力反抗没杀成，就不算杀人犯的罪行了吗？佐助做了很多特别过分的事情，只是没有实际结果罢了。再后来没有追究他主要是因为第六代火影是卡卡西，而第七代火影是鸣人，木叶最高层就是火影了，卡卡西特别善良从来没抛弃这个徒弟（虽然这个逆徒从来不叫自己老师），鸣人就更别说了他一直拿佐助当兄弟，也多亏是第四次忍战时佐助悬崖勒马有功于忍界更不予追究了。在疾风传晓组织大规模出动之前，大蛇丸几乎可以说是为所欲为了，接连干掉了四代风影、三代火影这两名强者。而在疾风传之后，大蛇丸的表现就稍显乏力了，反而是他的助手药师兜后来居上，不仅在龙地洞学会了仙人模式，而且将大蛇丸使用过的秽土转生发扬光大，成为了第四次忍界大战中的主要反派。那么药师兜和大蛇丸谁对忍界更有威胁呢？
毫无疑问，肯定是大蛇丸
与药师兜这名后起之秀相比，大蛇丸从小就是天才忍者，也是三代火影年轻时最器重的学生。后来青年时期的大蛇丸和自来也、纲手以三忍的称号闻名忍界，但是在第三次忍界大战过后，经历了亲人以及同伴相继死亡的大蛇丸，开始追求不老不死的永生之术，并为之不断进行木叶村严令禁止的人体实验。
以大蛇丸的天赋，他要是走正道的话肯定能造福一方，但是若往歪路上走那可能就祸满天下了。大蛇丸在正式叛逃前，就在团藏身边待过很长一段时间，而在这段时间里大蛇丸是没少帮团藏做那些阴暗的事的，药师兜小时候就是被团藏强行招揽到了身边当间谍，后来又被大蛇丸利用。而在大蛇丸做的人体实验被发现而逃离木叶后，他依然与团藏保持着密切的联系，连团藏身上的柱间细胞以及一手臂的写轮眼都是大蛇丸帮他移植的。
大蛇丸叛逃之后的事迹相信大家都知道，他不仅和君麻吕联手干掉了四代风影，而且还伪装成四代风影，带领砂隐村忍者袭击木叶。不仅木叶村遭到了严重的破坏，三代火影猿飞日斩也因此死在了自己的徒弟大蛇手里。
在大蛇丸的双手被三代火影尸鬼封尽封印后，他就急于得到佐助的身体，于是把寻求力量的佐助培养了三年，结果被成长起来的佐助反杀。在大蛇丸暂时退场后，移植了大蛇丸细胞的药师兜成为了第二个大蛇丸，他不仅在大蛇丸的基础上改进了秽土转生这个禁术，而且还与宇智波带土联手发动了第四次忍界大战。
药师兜将秽土转生发挥到了极致，他不仅将忍刀七人众、晓组织成员、大国历代影等众多强者复活，而且还能同时操控成千上万名秽土转生的亡者大军，这对忍者联军产生的威胁是远大于带土靠外道魔像培育出来的十万白绝的。但是兜并没有嚣张多久，就被别天神控制的宇智波鼬的伊邪那美制服，最终解除了秽土转生。
总而言之，虽然药师兜掀起的战斗规模比大蛇丸大得多，但是大蛇丸可是从青年时期就开始作恶，并且持续到了他五十多岁的时候才洗白。君麻吕、药师兜、宇智波佐助等人，都曾受到大蛇丸的蛊惑并留在了他的身边。所以一直在走大蛇丸老路的药师
说回宇智波，宇智波家族的创始人是因陀罗，他是六道仙人和一个地球人生的孩子，而六道仙人是辉夜和一个地球人生的孩子，所以到了因陀罗这一代，已经算是完全的人类了，包括样貌都跟地球人一样，只是继承了大筒木一族的血统。
不过因陀罗并没有继承全部，他所继承的是以写轮眼为代表的精神力量，繁衍了宇智波一族；他还有一个弟弟叫阿修罗，继承了以不灭之躯为代表的身体力量，繁衍了千手和漩涡一族。
很多人喜欢把这种力量叫仙人体，其实并不准确，因为仙术和大筒木一族的身体是完全不搭嘎的，六道仙人、自来也、四代、鸣人能够开仙人模式，都是在妙木山修行学会的，跟大筒木、千手、漩涡没有关系，天纵奇才的千手扉间不会仙术，辉夜也不会仙术。在鸣人和佐助的最后一战中，吸取大自然力量的仙术和吸取尾兽力量的查克拉对轰特别分明。
但有一种仙术例外，那就是木遁仙法，是初代阿修罗依靠不同族群人类之间的羁绊之力，加上六道的仙术查克拉引导获得，这也是为什么千年来那么多代因陀罗和阿修罗实力都在伯仲之间，只有拥有木遁的初代阿修罗和柱间形成了碾压。
再回到宇智波，因陀罗建立的宇智波一族和阿修罗建立的千手一族作为忍界最强的两大始祖家族，彼此争斗了千年，其中有很多原因，虽有黑绝的煽风点火，但我觉得主要还是人心不古。至于黑绝的身份，不清楚的就当他是个活了几千年的幕后黑手。
两大家族争斗千年后，终于来到了近代，宇智波斑和千手柱间出现了。
他们分别是因陀罗和阿修罗的第N代转世，而且他们从小就成为了知己，这就给和平带来了契机。
但是在一次战斗中，斑的弟弟泉奈被柱间的弟弟扉间用飞雷神斩打死，我们知道宇智波家族的人基本都是兄控**，这下旧仇未了又添新仇。正好那个时候斑因为过度使用万花筒快要瞎了，于是泉奈临死前把眼睛移植给了斑，结果不但恢复了光明，还意外的开启了永恒万花筒，之前所有人都不知道原来移植至亲的眼睛还有这种功效。
然而宇智波还是打不过千手一族，主要是拥有木遁仙法的柱间太强了，眼看着族人越打越少，斑决定单枪匹马跟柱间决战，但还是打输了。柱间此时站在顶点，拥有绝对的话语权，提出两大家族和解，共同成立忍者村。
宇智波与千手一族成立木叶村后，日子却并不好过，长年战争的仇恨没这么容易一笔勾销，而且宇智波一族也并不肯屈居人下。
此时，斑在祖庙南贺神社里发现了一个密室，里面的石碑上刻着六道仙人留下的文字，这些文字被设置成了要用自己的力量才能解读。
斑用永恒万花筒写轮眼的瞳力解读出了大部分信息，其中包括写轮眼、万花筒和轮回眼的开启方法，不过这个石碑发现的有点晚，这些秘密大部分已经在实践中得出了，唯有轮回眼对于斑来说是全新的领域。
石碑上写着宇智波的写轮眼之力为阴，千手一族的身体力量为阳，阴阳融合生出森罗万象，而石碑最后的一段信息，要用这森罗万象之轮回眼来解读，看来六道仙人希望宇智波和千手的后代结合，这段信息中包含着拯救世界的方法。
本来按照常理来讲，这时候斑和柱间应该一起破解石碑，但斑却没有这么做，他从石碑上得知了用万花筒控制尾兽的方法，打算离开木叶村，寻找尾兽。
柱间以为他是受到了排挤，对他进行挽留并打算让他当二代火影，不过斑此时使命感已经爆棚了，他的目光已经不局限于偏安一隅，而是心怀世界。
历时多年他找到了尾兽中最强的九尾，回到木叶与柱间决战，目的就是得到柱间的力量，开启轮回眼，拯救这个纷争不断的世界。
尽管控制了九尾，完全体·威装·须佐能乎加身，然而你大爷还是你大爷，柱间一手仙法·顶上化佛力克斑和九尾。
我推测一下此时这两人的实力，柱间拥有六道的身体力量和创造木叶的木遁仙法，与六道仙人只差一个写轮眼，其实力参照后期的鸣人。
而斑虽然拉来了九尾，但他的实力跟后期佐助比还差了个轮回眼，斑要想和柱间匹敌，至少得开轮回眼。
不过，斑的头脑在柱间之上，这场战斗他也不求一定要胜。战斗中他咬下了柱间的一块肉，已经达到了目的。
不过柱间此时心里只有木叶村，担心斑以后再搞破坏，直接出手杀了他。斑大吃一惊，显然没想到柱间真的下杀手。
不过好在万花筒写轮眼的禁术伊邪那岐，改写了他被杀的现实。幸存后，他把柱间的那块肉移植到自己身上，隐居起来，等待轮回眼的开启，这一等就直接等到快死了。在他即将大骂六道骗子寿终正寝时，轮回眼终于开了。
火影里面只有两个地球人开启了轮回眼，一个是宇智波斑，移植柱间的身体细胞后开启了轮回眼；还有一个是宇智波佐助，直接从六道仙人那里继承力量开启轮回眼。而这两人正好都是因陀罗的两代转世，千手柱间正好又是阿修罗的转世，所以我推测必须因陀罗与阿修罗的力量直接结合才能开启轮回眼，其他宇智波族人无法开启。这也是为什么带土既有万花筒又有柱间细胞却开不了轮回眼。轮回眼并不是万花筒写轮眼的进化，它的功能和万花筒完全不同，而且不可兼顾，例如六道仙人没有经过万花筒，直接从三勾玉开启了轮回眼。
斑在获得轮回眼后，趁着最后一点寿命，赶紧跑去石碑那里，知晓了一切秘密，原来现在忍者的查克拉来源是一棵树，这棵树只结了一颗果子，被辉夜给吃了，辉夜的儿子又把查克拉分散到世界各地，还把树给封印了。这棵树的外壳被封印在月球，被称作外道魔像，只有轮回眼才能解除封印，这棵树的力量被分成九份，化为九只尾兽，而拯救世界的方法，就是把这棵被称为"十尾"的树还原，用神树的力量把月球投影成超大写轮眼，发动无限月读，催眠世界上所有的人，在乌托邦式的幻术世界中永眠，基本上就跟电影《****》差不多。
不过这段文字被黑绝这个幕后黑手篡改了，发动无限月读是为了让辉夜复活，原本的信息只是陈述了忍宗的历史，然而结果导向型的斑对此深信不疑，原来这就是拯救世界的方法，听起来很科学啊，而且这样做能让身为**的他与自己死去的兄弟相见。
可最大的问题是他寿命即将耗尽，他用轮回眼通灵出了那棵树的外壳-外道魔像，依靠它的养分勉强维持寿命，但并非长久之计。他找到了漩涡长门，因为漩涡一族是千手一族的血亲，所以能够移植并使用轮回眼，斑把眼睛给了长门，让他长大学会轮回天生之术后复活自己，然而长门并没有听他的...