站在城墙上，看着逐渐远去的复明军，朱由栋感叹道：“这还是第一次没有随军出征。”朱由栋身边的袁廓宇道：“侯爷恐怕再想随军出征，可就不容易了。”朱由栋叹道：“是啊，现在后方一堆的事情，总要去处理。”
朱由栋说完，又看了下跪在城墙上的俘虏，这些都是被俘虏的一些大员，如洪承畴，多尼，罗可铎等人。朱由栋走了过去，向多尼道：“看你的样子很悲愤啊。”多尼愤怒的看着朱由栋没有说话。
城下被杀的就有接近一万的满洲青壮，这些可都是真正的满洲人啊。当初入关的满洲人总共也就二十万左右，还包括了其中的妇孺儿童。这一万青壮对汉人不算什么，但是对于满洲人来说，可就伤筋动骨了。
朱由栋见多尼不说话，接着道：“你现在觉得愤怒也没什么，我以后还会杀更多的满洲人。哦对了，我在贵阳也杀了两千镶红旗，在平夷所又杀了两千镶黄旗。在胜境关呢，估计也杀的有四千左右的正蓝旗满洲人。后来在响水关外，更是斩杀了一万左右的满洲八旗。这样算下来，你带进云贵的满洲八旗，怕是死的差不多了吧。如今又被我在昆明斩杀了这一万人，前前后后这杀的不下三万真满洲八旗了。”
看着面前趾高气扬的朱由栋，多尼等人更是咬牙切齿，但他们现在是俘虏，就算再怎么怒不可遏，也拿朱由栋没有办法。朱由栋见状笑道：“不知道当初你们对汉人进行屠杀的时候，有没有想过有报应的一天呢？”
多尼等人只是怒目而视，眼中尽是无尽的怒火。朱由栋就是要这样，让他们也同样感受同胞被屠杀的感受。朱由栋走道洪承畴面前，这时的洪承畴已经是六十六岁的老头，加上这段时间被关在牢里，整个人的神情萎靡不少。
朱由栋见了洪承畴的样子，道：“洪总督，还记得当年那句‘我大明的洪亨九’吗？”可能是朱由栋的声音有些小，洪承畴并没有听清楚朱由栋的话。洪承畴本来已经给清廷上奏疏说自己有眼疾，听力也不行了，乞求归养。
洪承畴见有人走到自己面前，抬头一看，居然是个年轻人，二十来岁。这几天洪承畴过的并不好，今天又在这城墙上跪了一上午。现在抬头一看，眯着眼睛盯了半天才有些清醒的道：“阁下是何人？你所领军队是那一支？如果能投降我大清，相信当今皇上的圣明，定能让你荣华富贵一身。”
朱由栋一听，顿时大怒，喝道：“好你个数典忘祖的畜生，就算是已经沦为阶下囚了，还不忘为你满洲的主子拉拢招降。”朱由栋突然想起一件传言来，据说当年洪承畴之所以会降清，全是因为大玉儿，也就是如今的孝庄出卖色相勾引了洪承畴。
朱由栋突然有些恶趣道：“洪承畴，你当初真的因为孝庄勾引才投降的吗？”旁边的多尼等人，听了朱由栋的话顿时都高声怒骂朱由栋，指责他侮辱孝庄名声，坏大清的朝廷威严。
朱由栋一听，顿时好笑道：“我反的就是你们满清，怎么骂不得吗？那好，既然你们如此想要隐瞒。我还要专门找人来出书，让他们来写写孝庄的风流韵事。加上现在洪承畴也在，正好以他自述的口吻说出去，那不是更加有趣。”
在一旁的袁廓宇一听，立即道：“侯爷这想法好，洪承畴等人一直宣传说清廷尊儒重道，想用天下正统来蛊惑民众。如今我们用同样的方法来揭露他们蛮夷的根本，这对我们抗清也是大有帮助。”
朱由栋道：“这个想法好啊，他们天天说自己是正统，全然忘记了自己根本就是蛮夷做派。这些投降清廷的败类，就是自愿堕落成为蛮夷的汉奸。”袁廓宇道：“是的，满清居然还出现了太后改嫁，给皇帝找个继父的事。这些可都是蛮夷才会有
的，简直就是毫无礼义廉耻。”
朱由栋道：“正好，万年策似乎很喜欢攻击他人的做派，就让他来做这事。”洪承畴这时稍微清醒一点，见袁廓宇居然已经投降了，顿时骂道：“袁廓宇，你这个卖祖求荣的奸贼，你出卖大清，你不得好死。”
袁廓宇见洪承畴居然这时候，还对自己出言不逊，当即道：“好你个洪老狗，你背叛大明，背叛汉人。你才不得好死，你还记得你返回泉州，你自己的老母都不认你，你又何面目存活于世。你简直就是猪狗不如，死了都是天厌地弃的东西。”
朱由栋也不想听袁廓宇和洪承畴两人互扯，道：“好了，这几人全部押回四川，现在还不能让他们，就这么简简单单的死了。我要当着全天下人的面，将他们千刀万剐，来祭奠那些为我汉人抛头颅，洒热血的汉家男儿。”
复明军该出征的已经全部都离开了昆明，现在昆明外面有民壮再清理被屠杀的八旗士兵。人头全部被挂在了昆明城的四周，整个昆明城的城墙上，密密麻麻的都是清兵的人头。
张佐宸来找朱由栋道：“侯爷，你将清军的俘虏全部杀了，鼓舞士气，这我没话说。但是将他们的人头，全部挂在昆明城墙上，这是不是显了我大明王师太过杀戮。”
朱由栋道：“不用怕，你以云南巡抚的名义，出一份告示。将这些清军在云南犯下的罪孽，全部罗列出来，张贴于四处城门，让军士每天宣读。还要队云南各府县，都要发出告示，让他们宣扬清军的残暴。”
张佐宸道：“侯爷是想借此宣扬清军的残暴，好让本地的土人靠向我大明？”朱由栋道：“是的，还有云南也要和贵州一样，继续引导和鼓励土人改为汉人，同汉人混居。只要他们从山里出来，能和汉人混居几代人后，他们也就和汉人没有丝毫区别了。”
张佐宸道：“侯爷这是不是有些操之过急了，现在清军还有二十几万的军队在云南。我们现在这样一来，恐怕会损害很多土司的权益，他们到时候不会愿意配合我们。”
朱由栋道：“我反而觉得正是时候，现在清军的二十万大军无粮。必定会对这些土人多方抢夺，这对他们来说已经是损害很多了，如今我们只是让他们出山。我们就让他们和汉人一样，公平的自由买卖，耕田种地。这对土人百姓来说，绝对是一个大好的消息。加上清军打击了那些土司力量，也让这些土人百姓对清军产生了很大的恨意，我们这时候出手，比任何时候都合适，我会让军队这边配合你们。”
张佐宸道：“既然侯爷已经决定了，我也没什么好说的。只是侯爷现在返回四川，怕是有些不妥吧，如果云南的清军被消灭，我们应该尽快出兵缅甸救回皇上。侯爷确返回了四川，到时候这大军调动怎么办？”
朱由栋道：“这个我也想到了，如果我们将云南的清军消灭后。估计晋王他们，也会迫不及待的去接回皇上。云南有没有我在影响都不大，我们毕竟离边境还有些距离，加上我们大军打败清军后，肯定也会损伤不少。估计到时后，我们的军队也只能为晋王他们打打帮手。反而是四川各地虽然被占领了，但当时急着想要进入云贵，四川并没有组建有效的地方官府，去治理地方，所以现在才急着回去。如果我们尽快的组织好地方官府，将会耽误了四川的春种，我们大军的粮草可就越发的艰难了。”
张佐宸道：“也对，四川自古就是天府之国，如今云贵川三省，也就四川能大量出粮。”朱由栋道：“正是如此，所以四川的这次春种更加不能出什么差错，我必须回去主持。”
张佐宸道:“那也行，侯爷回川后，云南的地方上该如何呢？”朱由栋道：“我让
马自德听从张阁老的调遣，由他组建云南巡抚的标营，下辖两千人。至于军队方面，现在大军都在云南，这到不用考虑。等到他们需要离开云南的时候，在另外派人在云南组建地方驻军吧。”
张佐宸道：“好，既然侯爷已经考虑的周到了，我也就不多说了。”朱由栋道：“只是这云南的民生方面，还要阁老多费心，对土人当以招抚为主。但是也不能惯着他们，有不愿意出山的，可以强行围剿。然后将这些人全部迁去四川，四川被清兵祸害，现在是千里无人烟。”
张佐宸道：“这些我明白，我一定配合军队方面，尽快让云南安定下来。”朱由栋道：“至于自愿去四川的人，巡抚衙门也要赠与路资，帮助他们去四川。等到可以的时候，我会让内地的汉人多迁一些到云南，这样一来，保证云南少些边祸。”
张佐宸道：“侯爷考虑的长远，就依侯爷的。”朱由栋道：“对了，万年策来找阁老了吗？”
张佐宸笑道：“当然来来了，其实万年策还是有些学问，也是能干事的人。只是这人太过于功利，所以侯爷看着就不喜欢罢了。我安排他为云南布政使参议，也算是为我分担一些，怎么侯爷觉得不妥吗？”
朱由栋道：“到也没什么不妥，只是我想他去做另外的事。”随后朱由栋将准备让万年策，专门去写一些打击清廷威信的书籍的事讲了出来。张佐宸一听，笑道：“侯爷这有些大才小用了，让他去做这事有些屈才，我看还是让他就在云南布政使衙门吧。关于侯爷想要写东西的想法，我给侯爷推荐一个人。”
朱由栋道：“什么人？”张佐宸道：“原清廷的云南按察副使李本晟”朱由栋奇道：“李本深，不是被处死了吗？他是武将，怎么成了文臣。”
张佐宸笑道：“不是原贵州总兵李本深，是另外一人，他之前为广西苍梧道佥事，今年二月才升调为云南的按察副使的。”
朱由栋道：“说起来他到时文官，但是他愿意为大明出力？如今这投降了满清的官，可各个都对清廷的忠心耿耿啊。”张佐宸道：“不怕，他刚被押回昆明，就被林壮将军，绑在了巡抚衙门前的柱子上，晒了三天。现在是一点脾气都没有，只要侯爷一声令下，我估计他能把他们家八辈子的事都说出来。”
朱由栋笑道：“看来什么忠心在刑罚面前都一文不值啊。”然后朱由栋站起来道：“好了，既然云南的事情交代清楚了，我也准备返回四川了，既然阁老推荐了李本晟，那就让他来吧，至于万年策就让他帮着阁老。”
张佐宸道：“好，那些被俘的满清大员，侯爷怎么处置？”朱由栋道：“先带回四川去，把他们留在云南，反而不放心了，毕竟现在云南军队里清廷的降军太多了。”
朱由栋将云南的事情安排一通后，第二天就带着三卫骑兵，自己的三千侍卫，带着清廷的重要俘虏，取道返回贵阳。在过贵阳的时候，朱由栋又对贵州的军队做了一番调整。
将李廷明等人的军队，整编为第十五军，以李廷明为指挥使，杨冬，王刘仓为卫总兵。这也是第一个从清军投降过来的指挥使，当李廷明知道自己被任命为指挥使的时候，特意的跑道朱由栋面前，重重的给朱由栋磕了一个头。
朱由栋见状道：“起来吧，只要你们是真心为我大明出力，我朱由栋不会亏待你们。不管你是清廷的降将，还是什么，都是一样的。”
李廷明顿时表示，要为朱由栋生死相随。随后朱由栋让李廷明将改编的军队，驻扎到普安州一带，防守胜境关。并派兵南下攻占广西的安隆司，与云南的广南府连成一片，防止清军反攻云南和突进贵州。