东汉时期的行政区划设置西汉末年，政治日益**，经济衰落，政治、经济、军事大权过于分散，最后导致公元9年王莽篡朝，改国号为“新”，建立王莽掌权的“新”王朝。王莽篡政后，大量网罗汉宗室功臣后裔、封建官僚，改郡封国，乱设行政区划，改变原来的区划名称，地名大乱，形成中国历史上行政区划极大的混乱时期。直至公元23年（地皇四年），各地起义军奋起，王莽被杀，新朝垮台，新莽政权被推翻，由绿林为首的地主阶级代表、西汉远支皇族刘玄取而代之，年号更始，新朝灭亡。后因政权内部角逐激烈。刘玄于更始三年投降赤眉军后被杀。实际上东汉王朝是从公元25年即汉光武帝刘秀建武元年开始的。
因“新”朝时间为时较短，仅存在15年，加之行政区划改动较大，又在管理体制上不成定局，故对其不作详细介绍。
公元25年，汉宗室代表刘秀权势较大，挫败各地割据势力，建立东汉朝（公元25～220年）。定都濉（去目加各）阳（今河南洛阳市东），始称东汉。
东汉的疆域基本上同西汉时疆域，只是把西汉时各部州的辖区范围变小，东汉在公元140年仍保持十二州刺史部（中央派出的监察机构，其职能基本同西汉）和司隶校尉部，计有十三个中央派出监察区。另在甘肃以西仍设西域都护府，作为西域当地的最高权力机构。东汉的一级行政区划为郡、国（王国）、属国都尉；二级区划为县、邑、道、公国，侯国。
东汉接受西汉衰亡的教训，加强郡县的权利，削弱封国的范围和力量，采取“封列侯，奉朝请”措施，不让封国掌实权，只食租税，封域减小，兵马数量压缩到最低限度。东汉的封国，—等为王（相当郡），二等为公国，三等为列侯（列侯食县为侯国、小侯食乡、亭，关内侯无土，寄食于县），相当于县级。
东汉中央官制
大体同于西汉，在朝廷中设太傅为上公，但不常置。以太尉（光武初称大司马）、司徒、司空为“三公”，亦即“三司”，而太尉职权较西汉广泛，列名于“三公”之首。“三公”之下所属分别设有长史、掾属、令史、御属等，而太尉之属官尤多，有多达二十四人，令吏及御属二十三人；令史又分合下令史、记室令史、门令史等。建安末，曹操为丞相，郗虑为御史大夫，罢去“三公”之官，只设置丞相、御史大夫。东汉也有“九卿”，大体如西汉，其不同者：（1）光禄勋（西投初为郎中令）设五官中郎将。（2）少府设尚书令，（献帝时分置左右仆射），设尚书六人，光武帝刘秀扩大组织，分为六曹。六曹尚书与尚书令、仆，合称为“八座”，大事“八座”连名上奏。尚书（台）设左右丞各一人，侍郎（即尚书郎）三十六人（每曹六人）；令史二十一人（每曹三人）。可见尚书（台）之机构已渐庞大，事权渐重，“三公”徒有虚位，形成了“政归台阁”局面。尚书（台）的设置，是开创性的，为后世各朝代中央政府的雏型，也表明皇权更为加重，这是东汉朝的特点。
东汉基本沿行西汉，分封王、侯与州、郡、县双轨并设之制。皇子封王，其封地为国，每国设傅一人，相一人，相职掌如太守。列侯所食县者为侯国。功大者食县，小者食乡、亭。乡侯、亭侯之封为东汉所特设，用以安置贵族、勋戚、功臣，扩大了统治集团，增长豪门世族的权势，但王侯之权力却已远远弱于西汉。东汉以司隶校尉管京都附郭一州，称为司隶，设校尉。司隶校尉之官“掌察举百官以下，及京师近尉犯法者”。光武帝时“并领一州”包括七个郡。其地位在“九卿”上，设十二从事史，司隶职权远较西汉为广泛，其辖包括两汉之西（京兆）、东（河南）二京。司隶之外，置十二州，每州设刺史一人（灵帝、献帝时，有的州改设牧），权力增大，州之下为郡，郡之下为县。在边地少数民族聚居之地设道。事实上已形成州、郡、县三级制。东汉前期，加大尚书（台）之权，削弱“三公”及地方郡国之权，以增强皇权。至末年为镇压人民起义，则改变了一贯政策，给各州之豪门大族以重权，遂形成了割据局面。
军事官制
东汉仍设将军、大将军、骡骑将军、车骑将军、卫将军之品秩如三公。将军下又有前、后、左、右将军，位比上卿。将军之下设长史、司马、从事中郎及掾属、令史、御属等。大将军管辖五部，每部有校尉一人，军司马一人。部下有曲，曲有军侯一人，曲下有屯，设屯长。东汉设北军五营：屯骑校尉、越骑校尉、步兵校尉、长水校尉、射声校尉，以北军中侯监五营。其警卫宫殿的属于光禄勋，如西叔南军。灵帝中平五年因农民起义声势洁大，增设西园八校尉以防守京都洛阳。东汉对于少数民族地区，设有军事性专官多种，既臣服于朝廷，又维护当地治安。
东汉官制的特点：（1）中央权力更为集中，集权于皇帝直接掌握之尚书（台）。（2）地方行政体制形成事实上的三级制（州、郡、县），强化对地方的控制。东汉末年，州牧拥兵割据，导致分裂局面的出现。（3）重视对少数民族地区的统治，设立各种专官，其主旨虽在控制人民，但对开发边区，促进中原与周边经济、文化的交流，也有一定的作用。
东汉建立后，在行政区划工作上做了两件大事，一是恢复西汉时的郡县名，清除王莽新朝时乱改的地名，重新规划全国的郡县，撤并了西汉时的县、道、邑、侯国400多个，王莽时增置的郡县基本上全部撤销，郡国数量相应减少。二是在州的建制上做了较大的变动，刘秀全部废除王莽所建的十二州牧，改交陟（去步加止，趾）为交州，恢复西汉的部州，并固定其州治驻所。升大州级的权力。至东汉末期，体制基本上实行州、郡、县三级。