“失落之城事件之后，僵尸设下的的陷阱足以灭掉一支军队。”(穷途末路)三流媒体采访一名退役军人时所了解到的信息，足以表明生化病毒进化速度之迅勐。以人类当时的技术，很难抵御x病毒感染体的进攻。
毕竟一个以人类姿态的强化z病毒感染体都要出动一个排的力量来消灭，更不要说洪水般来袭的x病毒感染体异型斗兽了。
很快，北美、亚洲、欧洲、非洲的部分地区和南美就陷落了。
世界随之成立了联合政府。
m国作为生化病毒爆发的起源地，运用其强大的科技力量遏制了生化病毒在国内的攻势。
rex博士为了躲避失控的感染体和政府军的追杀带着他的两个女儿逃往了冰岛，在先驱者公司的支持下在一个军事基地旁建立起了地下研究所。
先驱者公司在沙漠车站事件之后，被政府军封杀。
先驱者公司累计多年的科技军事力量终于爆发。
就这样，世界上掀起了与先驱者公司和生化病毒的战争。
此次战争规模比人类历史上的任何一次规模都要巨大，死亡人数也最多。
m国政府面临着内战与病毒的双重打击，只能请求联合政府派出第二先遣队去失落之城里寻找x病毒感染体样本，研究生物兵器来扭转战局。
于是崔智云率领的第二先遣队朝那个地狱出发了。
他们很不幸，刚刚进入失落之城就被困在了一个迷宫般的建筑内(生化魔方)。就在他们要逃离这个迷宫时，却遭到了x病毒突变体，急速型异型斗兽的袭击。
依靠他们的武器装备，是不可能将其击退的。
全队的士气笼罩在一片黑暗之中，甚至一部分队员选择了自尽。
崔智云则不断的鼓舞士气，也是徒劳。
就在万念俱灰之际，一道蓝光从空中出现，一个球形的传送门出现了。
身穿内骨骼盔甲的爱丽丝和a博士从未来穿越到了现代，爱丽丝使用一个人们从来都没见过的武器，将异型斗兽轻松的击倒。
他们是回来改变历史的。
崔智云：“你们是谁？”
a博士：“无需多问，等会会告诉你的，我们先离开这。”
a博士与爱丽丝带领着众人突破不断突破，来自未来的先进的武器处理僵尸非常轻松。
不一会时间a博士和爱丽丝就带领众人逃出了生化魔方。
崔智云：“你们究竟是何人？为什么救我们？”
a博士：“你们应该是政府的人吧？如果是那就请你们赶快联系救援，我们先离开这里，之后我会和你解释的。”
崔智云：“好吧，佩雷斯！赶快联系总部！”
很快政府派出的救援直升机赶到。
一行人被接回了政府总部，回到总部后联合政府主席召集所有人到会议室集合。
会议室内...
a博士：“我接下来要说的事你们可能不会相信，但是这一切确实是事实。”
在座都是各国政府的骨干，包括左尹...
a博士：“那么先自我介绍一下，我是来自未来世界政府的a博士。”
会议室内一片哗然...
“未来？”左尹满脸疑惑，她不相信未来已经掌握了时间穿梭的技术。
a博士：“请你们不要怀疑，我会证明自己，请你们看我带来的武器。”
a博士从背包里取出了一把手枪，然后他向楼顶射出一道绿色的光束，楼顶瞬间被射出一个小洞。
此时会议室里议论纷纷，这是他们从未见识过的武器。
a博士：“我来到这里是为了阻止rex博士和道格拉斯财团的，因为他们毁灭了地球。”
“你怎么知道rex博士，还有那个道格拉斯财团是什么？”左尹举手提问。
a博士：“因为我是rex博士的大学同学，他发现了z病毒以致全球爆发了生化危机，而道格拉斯财团就是一切的幕后主使，他们最终使用核弹制造了地球的核冬天，而在未来他们同样是巨大的威胁。”
“你竟然知道rex博士！”左尹开始有点相信这位自称来自未来的人，“但是核爆是怎么回事？”
在座的开始焦躁不安...
a博士：“大家安静！听我说完，这关乎我们所有人以及地球的命运。”
会议室内逐渐安静，人们越来越相信这位未来来客。
a博士：“下面请听我详细讲述一下未来的故事。
未来的某一天道格拉斯财团位于海上的总基地偶然间被发现，政府派出部队前去摧毁其秘密基地，可不曾想出现了一股神秘的宇宙力量迫使道格拉斯财团毁灭地球。
道格拉斯财团的创始人道格拉斯雅各布将隐藏的50颗核弹引爆，地球也随之毁灭，进入核冬天。
地球上的所有生物包括都被汽化、辐射而死。
一部分各国首脑和一些顶尖人才乘“方舟”号宇宙飞船逃往月球，建立月球空间站，运用太阳能和人造生态系统，种植粮食，研发科技，建造城市。
由于没有现代社会各种政治问题和经济问题等社会问题的干扰以及摆脱生化病毒的威胁的人们，仿佛进入了一个与世隔绝的桃花源，进行了一场技术爆炸。
半个世纪不到，人类的空间站已经遍布整个太阳系，除了已经进入核冬天的地球。
即便如此，反动势力和政府军的战争仍然没有结束，道格拉斯财团和联合政府仍然在太阳系的各个角落进行着不为人知的战斗。
眼看着政府军的政权即将被夺取，身为政府的高级科技人才的我为了稳固政权，便使用最新研发的时间机器穿越回了现代，希望改变历史，把我的大学同学rex博士的作品彻底毁灭。
就这样，我就穿越来到这里。”
“天哪！那道格拉斯财团现在在哪？我们必须赶快让其覆灭！”
“没错！他们居然拥有比我们联合政府还多的核弹储备。”
此时联合政府的高级军官出来控制场面并要求逮捕这位自称来自未来的a博士以及和一起的爱丽丝。
高级军官没有将a博士关入监狱，而是送到了联合政府总秘书长的办公室。
“抱歉，为了你的安全着想，我只好让这些军官将你押送到这，”总秘书长站起身来和a博士握手，“我是世界联合政府的总秘书长阿兹尔。”
“没事的，我知道你的好意。”a博士会心一笑。
“刚才前往失落之城执行任务的上尉崔智云已经和讲述了关于你的事，我相信你是从未来穿越而来的。”阿兹尔对眼前的这位带着厚厚眼镜的中老年人充满了信任。
“感谢你的理解，我这次回来一定会改写历史，让人类不会失去自己的家园。”a博士语重心长的说道。
“那好，接下来我会让政府里的首席研究员配合你工作，请你随着工作人员前往我们的地下研究所。”
在工作人员的带领下，a博士和助手爱丽丝来到了地下研究所。
正当他们想要休息时，左尹突然前来拜访。
“你好！博士，我是政府的首席研究员左尹，曾经为rex博士工作。”左尹开门见山表明自己的身份。
“哦？你曾经为rex工作过？”a博士打量着眼前这位年轻的女子。
“是的，虽然我还很年轻，但是我曾是rex研究所的首席研究员。”左尹看出了a博士的猜疑。
“真是年轻才俊啊！”a博士感叹道。
“请博士多多关照，以后我们就是同事了。”左尹微微鞠躬。
“同事吗？那好啊！你这么优秀的年轻人想要好好培养。”a博士慈祥的笑着。
“博士，我一定会全力以赴的！”
在a博士来到现代世界后，和联合政府的索尹一起建立了Aegis研究所，他决定全力扶持政府军，遏制先驱者公司和rex博士以及背后的道格拉斯财团的发展。
于是他打算将未来的技术传授给了现代社会。
为了防止先驱者公司窃取成果，他将每一个来自未来的系列武器都各自装到了一个密码箱里。然后将这些武器藏在世界各地以免被一方获得压倒性的力量，a博士知道联合政府也各怀鬼胎，只是拥有共同对付僵尸这一目标而已。
这种箱子在世界上稀疏分布，每个战士仅能凭运气发现，不过这种密码箱的材质十分坚硬，如果依靠现代科技强制拆开这个箱子，里面的武器也会被销毁。
而想打开这种箱子的唯一方法就是使用破译芯片打开，只有完成a博士的任务战士才能获得破译芯片，但是谁也不知道自己珍藏许久的密码箱里到底存着什么样的武器，只有亲自打开才能发现。
a博士也制定了计划，每年研发一把作为全年最强的武器来打击僵尸和先驱者公司以及道格拉斯财团。
由于这些武器过于强大被人们戏称为“年度神器”，他们也被放在了密码箱里，只有有缘的战士才能获得。
经过一年的发展，政府已经拥有了先进的科技与武器，a博士决定启动下一步计划，抓捕rex博士，遏制他对病毒的研究...